Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5K2

Usp33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp33Q8R5K2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Usp33Q8R5K2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Usp33Q8R5K2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Usp33Q8R5K2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Usp33Q8R5K2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Usp33Q8R5K2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Usp33Q8R5K2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Usp33Q8R5K2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Usp33Q8R5K2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Usp33Q8R5K2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Usp33Q8R5K2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Usp33Q8R5K2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Usp33Q8R5K2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Usp33Q8R5K2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Usp33Q8R5K2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Usp33Q8R5K2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Usp33Q8R5K2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Usp33Q8R5K2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Usp33Q8R5K2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Usp33Q8R5K2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Usp33Q8R5K2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Usp33Q8R5K2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Usp33Q8R5K2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Usp33Q8R5K2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Usp33Q8R5K2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Usp33Q8R5K2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Usp33Q8R5K2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Usp33Q8R5K2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Usp33Q8R5K2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Usp33Q8R5K2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Usp33Q8R5K2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,5 ms