Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4S1

Plce1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 2,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plce1Q8K4S1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plce1Q8K4S1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plce1Q8K4S1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plce1Q8K4S1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plce1Q8K4S1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plce1Q8K4S1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plce1Q8K4S1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plce1Q8K4S1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plce1Q8K4S1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plce1Q8K4S1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Plce1Q8K4S1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plce1Q8K4S1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plce1Q8K4S1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plce1Q8K4S1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plce1Q8K4S1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plce1Q8K4S1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plce1Q8K4S1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Plce1Q8K4S1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plce1Q8K4S1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plce1Q8K4S1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms