Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c1Q8K284 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c1Q8K284 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c1Q8K284 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c1Q8K284 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c1Q8K284 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c1Q8K284 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c1Q8K284 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c1Q8K284 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c1Q8K284 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c1Q8K284 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c1Q8K284 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c1Q8K284 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c1Q8K284 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c1Q8K284 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms