Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trpm6Q8CIR4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trpm6Q8CIR4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,58■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trpm6Q8CIR4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trpm6Q8CIR4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trpm6Q8CIR4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm6Q8CIR4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trpm6Q8CIR4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Trpm6Q8CIR4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Trpm6Q8CIR4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Trpm6Q8CIR4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Trpm6Q8CIR4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Trpm6Q8CIR4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trpm6Q8CIR4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Trpm6Q8CIR4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Trpm6Q8CIR4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Trpm6Q8CIR4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,8 ms