Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClmnQ8C5W0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ClmnQ8C5W0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ClmnQ8C5W0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ClmnQ8C5W0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ClmnQ8C5W0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ClmnQ8C5W0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ClmnQ8C5W0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClmnQ8C5W0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClmnQ8C5W0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClmnQ8C5W0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClmnQ8C5W0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClmnQ8C5W0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClmnQ8C5W0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClmnQ8C5W0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClmnQ8C5W0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ClmnQ8C5W0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ClmnQ8C5W0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClmnQ8C5W0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ClmnQ8C5W0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ClmnQ8C5W0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ClmnQ8C5W0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ClmnQ8C5W0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ClmnQ8C5W0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms