Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp26b1Q811W2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp26b1Q811W2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp26b1Q811W2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp26b1Q811W2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp26b1Q811W2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp26b1Q811W2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp26b1Q811W2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp26b1Q811W2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp26b1Q811W2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26b1Q811W2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26b1Q811W2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26b1Q811W2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26b1Q811W2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp26b1Q811W2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms