Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39,4■■■■□ 3,9
Kdm5bQ80Y84 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Kdm5bQ80Y84 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Kdm5bQ80Y84 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Kdm5bQ80Y84 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Kdm5bQ80Y84 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39,38■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39,33■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39,32■■■■□ 3,89
Kdm5bQ80Y84 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39,29■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Kdm5bQ80Y84 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39,25■■■■□ 3,87
Kdm5bQ80Y84 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39,25■■■■□ 3,87
Kdm5bQ80Y84 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,25■■■■□ 3,87
Kdm5bQ80Y84 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
Kdm5bQ80Y84 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Kdm5bQ80Y84 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39,18■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,18■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39,17■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39,14■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,86
Kdm5bQ80Y84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC39,11■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39,1■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Kdm5bQ80Y84 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,84
Kdm5bQ80Y84 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39,05■■■■□ 3,84
Kdm5bQ80Y84 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Kdm5bQ80Y84 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Kdm5bQ80Y84 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38,98■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Kdm5bQ80Y84 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38,93■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38,92■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Kdm5bQ80Y84 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Kdm5bQ80Y84 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Kdm5bQ80Y84 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Kdm5bQ80Y84 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Kdm5bQ80Y84 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Kdm5bQ80Y84 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Kdm5bQ80Y84 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Kdm5bQ80Y84 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38,8■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Kdm5bQ80Y84 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,74■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Kdm5bQ80Y84 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,69■■■■□ 3,78
Kdm5bQ80Y84 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms