Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT00

Supt20h, Transcription factor SPT20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt20hQ7TT00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt20hQ7TT00 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt20hQ7TT00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt20hQ7TT00 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt20hQ7TT00 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt20hQ7TT00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt20hQ7TT00 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt20hQ7TT00 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt20hQ7TT00 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt20hQ7TT00 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt20hQ7TT00 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt20hQ7TT00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt20hQ7TT00 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt20hQ7TT00 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt20hQ7TT00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt20hQ7TT00 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt20hQ7TT00 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt20hQ7TT00 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt20hQ7TT00 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt20hQ7TT00 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt20hQ7TT00 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt20hQ7TT00 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt20hQ7TT00 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt20hQ7TT00 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt20hQ7TT00 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt20hQ7TT00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt20hQ7TT00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt20hQ7TT00 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt20hQ7TT00 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms