Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msrb2Q78J03 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msrb2Q78J03 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msrb2Q78J03 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msrb2Q78J03 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msrb2Q78J03 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msrb2Q78J03 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msrb2Q78J03 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Msrb2Q78J03 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Msrb2Q78J03 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msrb2Q78J03 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msrb2Q78J03 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msrb2Q78J03 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Msrb2Q78J03 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msrb2Q78J03 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msrb2Q78J03 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msrb2Q78J03 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msrb2Q78J03 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms