Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ncapd3Q6ZQK0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ncapd3Q6ZQK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Ncapd3Q6ZQK0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ncapd3Q6ZQK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ncapd3Q6ZQK0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ncapd3Q6ZQK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ncapd3Q6ZQK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ncapd3Q6ZQK0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Ncapd3Q6ZQK0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ncapd3Q6ZQK0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ncapd3Q6ZQK0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ncapd3Q6ZQK0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ncapd3Q6ZQK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Ncapd3Q6ZQK0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ncapd3Q6ZQK0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ncapd3Q6ZQK0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms