Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NfrkbQ6PIJ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NfrkbQ6PIJ4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NfrkbQ6PIJ4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NfrkbQ6PIJ4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NfrkbQ6PIJ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfrkbQ6PIJ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NfrkbQ6PIJ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfrkbQ6PIJ4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NfrkbQ6PIJ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NfrkbQ6PIJ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NfrkbQ6PIJ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NfrkbQ6PIJ4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NfrkbQ6PIJ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NfrkbQ6PIJ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NfrkbQ6PIJ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NfrkbQ6PIJ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NfrkbQ6PIJ4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms