Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GmipQ6PGG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GmipQ6PGG2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GmipQ6PGG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms