Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GmipQ6PGG2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GmipQ6PGG2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GmipQ6PGG2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GmipQ6PGG2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GmipQ6PGG2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GmipQ6PGG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GmipQ6PGG2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GmipQ6PGG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GmipQ6PGG2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GmipQ6PGG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms