Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Med16Q6PGF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Med16Q6PGF3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Med16Q6PGF3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Med16Q6PGF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Med16Q6PGF3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Med16Q6PGF3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med16Q6PGF3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Med16Q6PGF3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Med16Q6PGF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med16Q6PGF3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Med16Q6PGF3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Med16Q6PGF3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med16Q6PGF3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms