Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cdk13Q69ZA1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cdk13Q69ZA1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cdk13Q69ZA1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cdk13Q69ZA1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cdk13Q69ZA1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cdk13Q69ZA1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cdk13Q69ZA1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cdk13Q69ZA1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cdk13Q69ZA1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cdk13Q69ZA1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cdk13Q69ZA1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cdk13Q69ZA1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cdk13Q69ZA1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdk13Q69ZA1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cdk13Q69ZA1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cdk13Q69ZA1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk13Q69ZA1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms