Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atp7bQ64446 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atp7bQ64446 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atp7bQ64446 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atp7bQ64446 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atp7bQ64446 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp7bQ64446 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atp7bQ64446 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atp7bQ64446 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atp7bQ64446 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp7bQ64446 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp7bQ64446 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp7bQ64446 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Atp7bQ64446 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atp7bQ64446 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp7bQ64446 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Atp7bQ64446 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Atp7bQ64446 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atp7bQ64446 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Atp7bQ64446 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Atp7bQ64446 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Atp7bQ64446 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Atp7bQ64446 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atp7bQ64446 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp7bQ64446 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atp7bQ64446 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atp7bQ64446 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atp7bQ64446 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atp7bQ64446 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp7bQ64446 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atp7bQ64446 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms