Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnc3Q63959 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnc3Q63959 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc3Q63959 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnc3Q63959 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnc3Q63959 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnc3Q63959 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnc3Q63959 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc3Q63959 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms