Protein–RNA interactions for Protein: Q61967

Zfp90, Zinc finger protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp90Q61967 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp90Q61967 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp90Q61967 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp90Q61967 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp90Q61967 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfp90Q61967 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp90Q61967 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfp90Q61967 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfp90Q61967 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zfp90Q61967 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zfp90Q61967 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp90Q61967 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zfp90Q61967 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp90Q61967 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp90Q61967 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp90Q61967 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp90Q61967 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp90Q61967 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp90Q61967 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zfp90Q61967 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms