Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psme4Q5SSW2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psme4Q5SSW2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Psme4Q5SSW2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme4Q5SSW2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme4Q5SSW2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme4Q5SSW2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Psme4Q5SSW2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Psme4Q5SSW2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Psme4Q5SSW2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Psme4Q5SSW2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Psme4Q5SSW2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Psme4Q5SSW2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Psme4Q5SSW2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Psme4Q5SSW2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Psme4Q5SSW2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Psme4Q5SSW2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Psme4Q5SSW2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Psme4Q5SSW2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Psme4Q5SSW2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psme4Q5SSW2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Psme4Q5SSW2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psme4Q5SSW2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms