Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trav6-2Q5R1I4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav6-2Q5R1I4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trav6-2Q5R1I4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav6-2Q5R1I4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav6-2Q5R1I4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trav6-2Q5R1I4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trav6-2Q5R1I4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms