Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DroshaQ5HZJ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DroshaQ5HZJ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DroshaQ5HZJ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DroshaQ5HZJ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DroshaQ5HZJ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DroshaQ5HZJ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DroshaQ5HZJ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DroshaQ5HZJ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DroshaQ5HZJ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DroshaQ5HZJ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DroshaQ5HZJ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DroshaQ5HZJ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
DroshaQ5HZJ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DroshaQ5HZJ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DroshaQ5HZJ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DroshaQ5HZJ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DroshaQ5HZJ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DroshaQ5HZJ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DroshaQ5HZJ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DroshaQ5HZJ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DroshaQ5HZJ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DroshaQ5HZJ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DroshaQ5HZJ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
DroshaQ5HZJ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DroshaQ5HZJ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DroshaQ5HZJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
DroshaQ5HZJ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms