Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PABPC1LQ4VXU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PABPC1LQ4VXU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PABPC1LQ4VXU2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PABPC1LQ4VXU2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PABPC1LQ4VXU2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms