Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
H2-Q2Q4KN81 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2-Q2Q4KN81 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2-Q2Q4KN81 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2-Q2Q4KN81 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
H2-Q2Q4KN81 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2-Q2Q4KN81 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2-Q2Q4KN81 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2-Q2Q4KN81 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2-Q2Q4KN81 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2-Q2Q4KN81 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2-Q2Q4KN81 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q2Q4KN81 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q2Q4KN81 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2-Q2Q4KN81 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2-Q2Q4KN81 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2-Q2Q4KN81 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1036.8 ms