Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prr7Q3V0I2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prr7Q3V0I2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prr7Q3V0I2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prr7Q3V0I2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Prr7Q3V0I2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prr7Q3V0I2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prr7Q3V0I2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prr7Q3V0I2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prr7Q3V0I2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prr7Q3V0I2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prr7Q3V0I2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prr7Q3V0I2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prr7Q3V0I2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prr7Q3V0I2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prr7Q3V0I2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prr7Q3V0I2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prr7Q3V0I2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prr7Q3V0I2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prr7Q3V0I2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prr7Q3V0I2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prr7Q3V0I2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prr7Q3V0I2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prr7Q3V0I2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prr7Q3V0I2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prr7Q3V0I2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms