Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Shroom4Q1W617 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Shroom4Q1W617 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Shroom4Q1W617 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Shroom4Q1W617 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Shroom4Q1W617 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Shroom4Q1W617 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Shroom4Q1W617 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Shroom4Q1W617 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Shroom4Q1W617 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Shroom4Q1W617 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Shroom4Q1W617 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Shroom4Q1W617 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Shroom4Q1W617 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Shroom4Q1W617 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Shroom4Q1W617 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Shroom4Q1W617 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Shroom4Q1W617 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Shroom4Q1W617 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Shroom4Q1W617 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Shroom4Q1W617 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
Shroom4Q1W617 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Shroom4Q1W617 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Shroom4Q1W617 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Shroom4Q1W617 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Shroom4Q1W617 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Shroom4Q1W617 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Shroom4Q1W617 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Shroom4Q1W617 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Shroom4Q1W617 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Shroom4Q1W617 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Shroom4Q1W617 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Shroom4Q1W617 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Shroom4Q1W617 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Shroom4Q1W617 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Shroom4Q1W617 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Shroom4Q1W617 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Shroom4Q1W617 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Shroom4Q1W617 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Shroom4Q1W617 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Shroom4Q1W617 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Shroom4Q1W617 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
Shroom4Q1W617 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Shroom4Q1W617 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Shroom4Q1W617 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Shroom4Q1W617 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Shroom4Q1W617 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Shroom4Q1W617 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Shroom4Q1W617 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Shroom4Q1W617 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Shroom4Q1W617 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Shroom4Q1W617 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Shroom4Q1W617 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Shroom4Q1W617 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Shroom4Q1W617 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Shroom4Q1W617 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Shroom4Q1W617 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Shroom4Q1W617 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Shroom4Q1W617 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Shroom4Q1W617 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Shroom4Q1W617 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
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