Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 NPP1YCR026C 2229 nt8.91□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 OXA1YER154W 1209 nt8.91□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 FRE6YLL051C 2139 nt8.91□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 OPI10YOL032W 741 nt8.91□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 FMS1YMR020W 1527 nt8.9□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 GLR1YPL091W 1452 nt8.9□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 RSC8YFR037C 1674 nt8.9□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 SFP1YLR403W 2052 nt8.9□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 SEC61YLR378C 1443 nt8.89□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 SPP2YOR148C 558 nt8.89□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 CCT2YIL142W 1584 nt8.89□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 FLR1YBR008C 1647 nt8.88□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 ACH1YBL015W 1581 nt8.88□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 YPS3YLR121C 1527 nt8.87□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.87□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 YLR111WYLR111W 333 nt8.86□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 DLD2YDL178W 1593 nt8.86□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 RIB3YDR487C 627 nt8.84□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 PHO23YNL097C 993 nt8.84□□□□□ -0.99
RPN6Q12377 BNI5YNL166C 1347 nt8.83□□□□□ -1
RPN6Q12377 VPS62YGR141W 1404 nt8.83□□□□□ -1
RPN6Q12377 MSC1YML128C 1542 nt8.83□□□□□ -1
RPN6Q12377 COQ8YGL119W 1506 nt8.82□□□□□ -1
RPN6Q12377 ACO2YJL200C 2370 nt8.82□□□□□ -1
RPN6Q12377 CAB5YDR196C 726 nt8.82□□□□□ -1
RPN6Q12377 ARO8YGL202W 1503 nt8.81□□□□□ -1
RPN6Q12377 YER188WYER188W 720 nt8.81□□□□□ -1
RPN6Q12377 LSB6YJL100W 1824 nt8.8□□□□□ -1
RPN6Q12377 YDL086WYDL086W 822 nt8.8□□□□□ -1
RPN6Q12377 PRY1YJL079C 900 nt8.8□□□□□ -1
RPN6Q12377 YMR226CYMR226C 804 nt8.8□□□□□ -1
RPN6Q12377 GND1YHR183W 1470 nt8.8□□□□□ -1
RPN6Q12377 YMR209CYMR209C 1374 nt8.79□□□□□ -1
RPN6Q12377 FUB1YCR076C 753 nt8.79□□□□□ -1
RPN6Q12377 CSM1YCR086W 573 nt8.79□□□□□ -1
RPN6Q12377 YMR244WYMR244W 1068 nt8.79□□□□□ -1
RPN6Q12377 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.78□□□□□ -1
RPN6Q12377 SMM1YNR015W 1155 nt8.78□□□□□ -1
RPN6Q12377 HEM13YDR044W 987 nt8.77□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 KES1YPL145C 1305 nt8.77□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 HIS2YFR025C 1008 nt8.76□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 ESBP6YNL125C 2022 nt8.75□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 NUC1YJL208C 990 nt8.75□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 BET2YPR176C 978 nt8.75□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 LOT5YKL183W 921 nt8.74□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 SGA1YIL099W 1650 nt8.74□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 UGP1YKL035W 1500 nt8.73□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 OSH7YHR001W 1314 nt8.73□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 LSB5YCL034W 1065 nt8.72□□□□□ -1.01
RPN6Q12377 QDR2YIL121W 1629 nt8.71□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 DIG1YPL049C 1359 nt8.71□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 BSP1YPR171W 1731 nt8.71□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 RAS2YNL098C 969 nt8.7□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 SAM3YPL274W 1764 nt8.69□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 ZAP1YJL056C 2643 nt8.68□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 RPT5YOR117W 1305 nt8.68□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.67□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 TPO4YOR273C 1980 nt8.66□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 HMG2YLR450W 3138 nt8.66□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 HXT12YIL170W 1374 nt8.66□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 TAT2YOL020W 1779 nt8.66□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 SOL2YCR073W-A 948 nt8.65□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 RBG2YGR173W 1107 nt8.65□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 YJL118WYJL118W 660 nt8.65□□□□□ -1.02
RPN6Q12377 EAF3YPR023C 1206 nt8.64□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 VRG4YGL225W 1014 nt8.63□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 OYE2YHR179W 1203 nt8.63□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 YJL055WYJL055W 738 nt8.63□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 GPN2YOR262W 1044 nt8.63□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 ILV2YMR108W 2064 nt8.63□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 GID8YMR135C 1368 nt8.62□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 AIM1YAL046C 357 nt8.62□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 PSD1YNL169C 1503 nt8.62□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 YPI1YFR003C 468 nt8.61□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.61□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.61□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.61□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.61□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 YHL008CYHL008C 1884 nt8.61□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 TPS1YBR126C 1488 nt8.59□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 ENT4YLL038C 744 nt8.59□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 RFC1YOR217W 2586 nt8.59□□□□□ -1.03
RPN6Q12377 DTR1YBR180W 1719 nt8.58□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 CYT1YOR065W 930 nt8.58□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 MRS6YOR370C 1812 nt8.57□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 YDR455CYDR455C 309 nt8.57□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 RIB7YBR153W 735 nt8.57□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 RIB2YOL066C 1776 nt8.56□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 YLR046CYLR046C 813 nt8.56□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 YKL133CYKL133C 1392 nt8.56□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 GAL3YDR009W 1563 nt8.56□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 YHR219WYHR219W 1875 nt8.55□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 DMA2YNL116W 1569 nt8.54□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 DLD3YEL071W 1491 nt8.54□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 LSM5YER146W 282 nt8.54□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 GTB1YDR221W 2109 nt8.54□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 SSL2YIL143C 2532 nt8.53□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 YNR029CYNR029C 1290 nt8.53□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 ODC1YPL134C 933 nt8.53□□□□□ -1.04
RPN6Q12377 DDI1YER143W 1287 nt8.52□□□□□ -1.05
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