Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 MCM5YLR274W 2328 nt8.09□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 ALP1YNL270C 1722 nt8.09□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 HIS2YFR025C 1008 nt8.08□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 TOA2YKL058W 369 nt8.08□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 PET8YNL003C 855 nt8.08□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 AKR2YOR034C 2250 nt8.08□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 OYE3YPL171C 1203 nt8.07□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 BRR1YPR057W 1026 nt8.07□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 CCT2YIL142W 1584 nt8.05□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 COQ8YGL119W 1506 nt8.05□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 TSC10YBR265W 963 nt8.05□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 YPL251WYPL251W 303 nt8.04□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 Q0010Q0010 387 nt8.04□□□□□ -1.12
VAM3Q12241 GLR1YPL091W 1452 nt8.02□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.02□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 NME1NME1 340 nt8.02□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 ARO8YGL202W 1503 nt8.02□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 GND2YGR256W 1479 nt8.01□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 SBA1YKL117W 651 nt8.01□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 ZTA1YBR046C 1005 nt8.01□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 SDH5YOL071W 489 nt8□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 SAM2YDR502C 1155 nt7.99□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 KES1YPL145C 1305 nt7.99□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 YLR279WYLR279W 390 nt7.98□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 MEP3YPR138C 1470 nt7.98□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 UGP1YKL035W 1500 nt7.98□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 VPS62YGR141W 1404 nt7.97□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 YGR012WYGR012W 1182 nt7.97□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 SPP2YOR148C 558 nt7.97□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 BET2YPR176C 978 nt7.97□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 SGA1YIL099W 1650 nt7.96□□□□□ -1.13
VAM3Q12241 YMR209CYMR209C 1374 nt7.96□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 FMS1YMR020W 1527 nt7.95□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 YDL086WYDL086W 822 nt7.95□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 RAD23YEL037C 1197 nt7.95□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 YMR103CYMR103C 363 nt7.95□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 RSC8YFR037C 1674 nt7.95□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 YMR244WYMR244W 1068 nt7.94□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 LSB6YJL100W 1824 nt7.94□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 YLR111WYLR111W 333 nt7.93□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 SEC61YLR378C 1443 nt7.93□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 MSB4YOL112W 1479 nt7.93□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 ACH1YBL015W 1581 nt7.93□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 YJR154WYJR154W 1041 nt7.92□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 YMR226CYMR226C 804 nt7.92□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 OXA1YER154W 1209 nt7.91□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 YPS3YLR121C 1527 nt7.91□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 QDR2YIL121W 1629 nt7.9□□□□□ -1.14
VAM3Q12241 FLR1YBR008C 1647 nt7.89□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 DIG1YPL049C 1359 nt7.88□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 YLR173WYLR173W 1827 nt7.88□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 DLD2YDL178W 1593 nt7.88□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 APT2YDR441C 546 nt7.87□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 RIB3YDR487C 627 nt7.87□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 TOM71YHR117W 1920 nt7.86□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 YRF1-2YER190W 5046 nt7.86□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 NSG2YNL156C 900 nt7.86□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.86□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 YDR306CYDR306C 1437 nt7.86□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 ZAP1YJL056C 2643 nt7.85□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 MTO1YGL236C 2010 nt7.85□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 CYT1YOR065W 930 nt7.85□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 FCY21YER060W 1587 nt7.84□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 PSD1YNL169C 1503 nt7.84□□□□□ -1.15
VAM3Q12241 YHL008CYHL008C 1884 nt7.83□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 SFL1YOR140W 2301 nt7.83□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 HXK1YFR053C 1458 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 CAB5YDR196C 726 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 YER188WYER188W 720 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 TPN1YGL186C 1740 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 RBG2YGR173W 1107 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 DMA2YNL116W 1569 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 ALR1YOL130W 2580 nt7.82□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 GID8YMR135C 1368 nt7.81□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 PHO23YNL097C 993 nt7.8□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 GND1YHR183W 1470 nt7.8□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 BNI5YNL166C 1347 nt7.79□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 MSC1YML128C 1542 nt7.78□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 HEM13YDR044W 987 nt7.78□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 ODC1YPL134C 933 nt7.78□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 OSH7YHR001W 1314 nt7.78□□□□□ -1.16
VAM3Q12241 GNP1YDR508C 1992 nt7.77□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 YKL133CYKL133C 1392 nt7.76□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 FUB1YCR076C 753 nt7.76□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 PUS7YOR243C 2031 nt7.75□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 LOT5YKL183W 921 nt7.75□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 SMM1YNR015W 1155 nt7.75□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 ALD5YER073W 1563 nt7.75□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 MRS6YOR370C 1812 nt7.74□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 PRY1YJL079C 900 nt7.74□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 NUC1YJL208C 990 nt7.74□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 DUR3YHL016C 2208 nt7.74□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 SSL2YIL143C 2532 nt7.74□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 ENT4YLL038C 744 nt7.73□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 RTG2YGL252C 1767 nt7.72□□□□□ -1.17
VAM3Q12241 CWP2YKL096W-A 279 nt7.71□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 AIM1YAL046C 357 nt7.71□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 YLR046CYLR046C 813 nt7.71□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 CSM1YCR086W 573 nt7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms