Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ebf1Q07802 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ebf1Q07802 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf1Q07802 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ebf1Q07802 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ebf1Q07802 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ebf1Q07802 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ebf1Q07802 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms