Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 MRS6YOR370C 1812 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG17Q06410 HXT10YFL011W 1641 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG17Q06410 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG17Q06410 SBA1YKL117W 651 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG17Q06410 PEX25YPL112C 1185 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG17Q06410 RFC1YOR217W 2586 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG17Q06410 SFA1YDL168W 1161 nt8.9□□□□□ -0.98
ATG17Q06410 YPL251WYPL251W 303 nt8.89□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 MTG2YHR168W 1557 nt8.89□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 SAM2YDR502C 1155 nt8.88□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 PHO23YNL097C 993 nt8.88□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 YPS3YLR121C 1527 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 CWP2YKL096W-A 279 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 PAU7YAR020C 168 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 PEX2YJL210W 816 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 LSR1LSR1 1175 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 AKR2YOR034C 2250 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 MEX67YPL169C 1800 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 NBA1YOL070C 1506 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG17Q06410 FLR1YBR008C 1647 nt8.83□□□□□ -1
ATG17Q06410 TIM44YIL022W 1296 nt8.82□□□□□ -1
ATG17Q06410 MET28YIR017C 564 nt8.82□□□□□ -1
ATG17Q06410 YHR219WYHR219W 1875 nt8.82□□□□□ -1
ATG17Q06410 TOK1YJL093C 2076 nt8.82□□□□□ -1
ATG17Q06410 YDR010CYDR010C 333 nt8.81□□□□□ -1
ATG17Q06410 HIP1YGR191W 1812 nt8.81□□□□□ -1
ATG17Q06410 HEM14YER014W 1620 nt8.8□□□□□ -1
ATG17Q06410 YFL066CYFL066C 1179 nt8.8□□□□□ -1
ATG17Q06410 YMR103CYMR103C 363 nt8.8□□□□□ -1
ATG17Q06410 ALP1YNL270C 1722 nt8.8□□□□□ -1
ATG17Q06410 DLD2YDL178W 1593 nt8.79□□□□□ -1
ATG17Q06410 YFR018CYFR018C 1092 nt8.79□□□□□ -1
ATG17Q06410 AGP3YFL055W 1677 nt8.78□□□□□ -1
ATG17Q06410 SEC61YLR378C 1443 nt8.78□□□□□ -1
ATG17Q06410 RPD3YNL330C 1302 nt8.78□□□□□ -1
ATG17Q06410 MTO1YGL236C 2010 nt8.75□□□□□ -1.01
ATG17Q06410 OXA1YER154W 1209 nt8.75□□□□□ -1.01
ATG17Q06410 NRT1YOR071C 1797 nt8.75□□□□□ -1.01
ATG17Q06410 YMR262WYMR262W 942 nt8.74□□□□□ -1.01
ATG17Q06410 MDL2YPL270W 2322 nt8.72□□□□□ -1.01
ATG17Q06410 DLD3YEL071W 1491 nt8.72□□□□□ -1.01
ATG17Q06410 YLR046CYLR046C 813 nt8.72□□□□□ -1.01
ATG17Q06410 HEM13YDR044W 987 nt8.71□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 FIT3YOR383C 615 nt8.71□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 UTH1YKR042W 1098 nt8.7□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 MIM1YOL026C 342 nt8.7□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 AIM1YAL046C 357 nt8.69□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 INH1YDL181W 258 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 ENT4YLL038C 744 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 PHO89YBR296C 1725 nt8.67□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 MSF1YPR047W 1410 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 KRR1YCL059C 951 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 YER188WYER188W 720 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 RIM2YBR192W 1134 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG17Q06410 RRT5YFR032C 870 nt8.64□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 RPC31YNL151C 756 nt8.64□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 OSH7YHR001W 1314 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 YDR094WYDR094W 336 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 VMA11YPL234C 495 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 DAK2YFL053W 1776 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 CLB6YGR109C 1143 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 COQ2YNR041C 1119 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 HBS1YKR084C 1836 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 UFD1YGR048W 1086 nt8.6□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 TIP1YBR067C 633 nt8.6□□□□□ -1.03
ATG17Q06410 FUB1YCR076C 753 nt8.58□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 BNI5YNL166C 1347 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 ITR2YOL103W 1830 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 LSM5YER146W 282 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 MIR1YJR077C 936 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 RBG1YAL036C 1110 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 LSB5YCL034W 1065 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 RSC4YKR008W 1878 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 FIT1YDR534C 1587 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 DPL1YDR294C 1770 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 UBA4YHR111W 1323 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 LEU4YNL104C 1860 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 MSC1YML128C 1542 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 TPN1YGL186C 1740 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 FET5YFL041W 1869 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 RPL4BYDR012W 1089 nt8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms