Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Fmn1Q05860 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Fmn1Q05860 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Fmn1Q05860 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Fmn1Q05860 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Fmn1Q05860 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Fmn1Q05860 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Fmn1Q05860 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Fmn1Q05860 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Fmn1Q05860 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Fmn1Q05860 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Fmn1Q05860 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Fmn1Q05860 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Fmn1Q05860 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Fmn1Q05860 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Fmn1Q05860 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Fmn1Q05860 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Fmn1Q05860 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Fmn1Q05860 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Fmn1Q05860 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Fmn1Q05860 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Fmn1Q05860 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Fmn1Q05860 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Fmn1Q05860 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Fmn1Q05860 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Fmn1Q05860 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Fmn1Q05860 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Fmn1Q05860 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Fmn1Q05860 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Fmn1Q05860 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Fmn1Q05860 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Fmn1Q05860 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Fmn1Q05860 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Fmn1Q05860 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Fmn1Q05860 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Fmn1Q05860 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Fmn1Q05860 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Fmn1Q05860 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Fmn1Q05860 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Fmn1Q05860 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Fmn1Q05860 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Fmn1Q05860 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Fmn1Q05860 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Fmn1Q05860 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Fmn1Q05860 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Fmn1Q05860 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Fmn1Q05860 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Fmn1Q05860 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Fmn1Q05860 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Fmn1Q05860 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Fmn1Q05860 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Fmn1Q05860 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
Fmn1Q05860 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Fmn1Q05860 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Fmn1Q05860 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Fmn1Q05860 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Fmn1Q05860 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Fmn1Q05860 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Fmn1Q05860 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Fmn1Q05860 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Fmn1Q05860 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Fmn1Q05860 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Fmn1Q05860 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Fmn1Q05860 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms