Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CkbQ04447 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CkbQ04447 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CkbQ04447 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CkbQ04447 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CkbQ04447 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CkbQ04447 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CkbQ04447 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CkbQ04447 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CkbQ04447 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CkbQ04447 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CkbQ04447 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CkbQ04447 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CkbQ04447 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CkbQ04447 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CkbQ04447 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CkbQ04447 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CkbQ04447 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CkbQ04447 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CkbQ04447 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CkbQ04447 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms