Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 YHR219WYHR219W 1875 nt7.26□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 YKL133CYKL133C 1392 nt7.25□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 PRO1YDR300C 1287 nt7.25□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 YNL115CYNL115C 1935 nt7.25□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 HUA1YGR268C 597 nt7.24□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 SBA1YKL117W 651 nt7.24□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 YML089CYML089C 369 nt7.24□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 HBS1YKR084C 1836 nt7.24□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 SHH4YLR164W 507 nt7.23□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 GNP1YDR508C 1992 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 MIM1YOL026C 342 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 LEU9YOR108W 1815 nt7.22□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 FET5YFL041W 1869 nt7.21□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 POM34YLR018C 900 nt7.21□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 PEX25YPL112C 1185 nt7.21□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 OYE3YPL171C 1203 nt7.21□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 FMS1YMR020W 1527 nt7.21□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 ATG15YCR068W 1563 nt7.2□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 THI6YPL214C 1623 nt7.19□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 DUR3YHL016C 2208 nt7.19□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 LIP1YMR298W 453 nt7.19□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 PET8YNL003C 855 nt7.19□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 SPP2YOR148C 558 nt7.19□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 YDL086WYDL086W 822 nt7.17□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 LSR1LSR1 1175 nt7.16□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 PRE6YOL038W 765 nt7.16□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 DUS3YLR401C 2007 nt7.16□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 SED1YDR077W 1017 nt7.15□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 YMR262WYMR262W 942 nt7.15□□□□□ -1.26
PKR1Q03880 VPS62YGR141W 1404 nt7.14□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 PAU7YAR020C 168 nt7.14□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 LSB5YCL034W 1065 nt7.14□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YPS3YLR121C 1527 nt7.13□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.13□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.13□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.13□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.13□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.13□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 FLR1YBR008C 1647 nt7.12□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 GCD11YER025W 1584 nt7.12□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YNL190WYNL190W 615 nt7.11□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 LAS17YOR181W 1902 nt7.11□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 YPL251WYPL251W 303 nt7.1□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 RIM2YBR192W 1134 nt7.1□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 DLD3YEL071W 1491 nt7.1□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 POP2YNR052C 1302 nt7.09□□□□□ -1.27
PKR1Q03880 TIM44YIL022W 1296 nt7.08□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 ADO1YJR105W 1023 nt7.08□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 SAM1YLR180W 1149 nt7.08□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 RPD3YNL330C 1302 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 LSM5YER146W 282 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 YFL066CYFL066C 1179 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 TOM6YOR045W 186 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 BRR1YPR057W 1026 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 MET30YIL046W 1923 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 ADE2YOR128C 1716 nt7.07□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 DPL1YDR294C 1770 nt7.06□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 MRPL8YJL063C 717 nt7.06□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 YAR028WYAR028W 705 nt7.06□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 YDR306CYDR306C 1437 nt7.06□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 SNU66YOR308C 1764 nt7.05□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 SFA1YDL168W 1161 nt7.05□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 TIF6YPR016C 738 nt7.05□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 YDR010CYDR010C 333 nt7.04□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 HEM13YDR044W 987 nt7.04□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 TOA2YKL058W 369 nt7.04□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 ORT1YOR130C 879 nt7.04□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 HIP1YGR191W 1812 nt7.04□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 SAM2YDR502C 1155 nt7.03□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 YFR018CYFR018C 1092 nt7.03□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 RPC31YNL151C 756 nt7.03□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 GND2YGR256W 1479 nt7.03□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 PMA2YPL036W 2844 nt7.03□□□□□ -1.28
PKR1Q03880 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.02□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.02□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.02□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 INH1YDL181W 258 nt7.02□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 MET28YIR017C 564 nt7.02□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 MTG2YHR168W 1557 nt7.02□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 ADE16YLR028C 1776 nt7.02□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 ECM10YEL030W 1935 nt7.01□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 HXT11YOL156W 1704 nt7.01□□□□□ -1.29
PKR1Q03880 DLD2YDL178W 1593 nt7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms