Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Grin2bQ01097 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Grin2bQ01097 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Grin2bQ01097 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Grin2bQ01097 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Grin2bQ01097 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Grin2bQ01097 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Grin2bQ01097 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Grin2bQ01097 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Grin2bQ01097 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Grin2bQ01097 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Grin2bQ01097 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Grin2bQ01097 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Grin2bQ01097 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Grin2bQ01097 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Grin2bQ01097 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Grin2bQ01097 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Grin2bQ01097 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Grin2bQ01097 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Grin2bQ01097 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Grin2bQ01097 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Grin2bQ01097 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Grin2bQ01097 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Grin2bQ01097 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Grin2bQ01097 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Grin2bQ01097 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Grin2bQ01097 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Grin2bQ01097 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Grin2bQ01097 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Grin2bQ01097 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Grin2bQ01097 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Grin2bQ01097 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Grin2bQ01097 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Grin2bQ01097 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Grin2bQ01097 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Grin2bQ01097 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Grin2bQ01097 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Grin2bQ01097 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Grin2bQ01097 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Grin2bQ01097 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Grin2bQ01097 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Grin2bQ01097 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Grin2bQ01097 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Grin2bQ01097 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Grin2bQ01097 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Grin2bQ01097 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Grin2bQ01097 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Grin2bQ01097 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms