Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab33aP97950 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab33aP97950 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab33aP97950 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Rab33aP97950 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab33aP97950 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab33aP97950 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab33aP97950 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab33aP97950 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab33aP97950 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab33aP97950 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab33aP97950 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab33aP97950 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms