Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry1P97784 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cry1P97784 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cry1P97784 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cry1P97784 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry1P97784 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry1P97784 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cry1P97784 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cry1P97784 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry1P97784 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry1P97784 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry1P97784 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry1P97784 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cry1P97784 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cry1P97784 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cry1P97784 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry1P97784 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cry1P97784 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry1P97784 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry1P97784 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry1P97784 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry1P97784 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cry1P97784 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry1P97784 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry1P97784 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry1P97784 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry1P97784 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry1P97784 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry1P97784 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry1P97784 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry1P97784 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry1P97784 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry1P97784 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cry1P97784 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cry1P97784 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms