Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nkx2-3P97334 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nkx2-3P97334 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nkx2-3P97334 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nkx2-3P97334 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nkx2-3P97334 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nkx2-3P97334 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nkx2-3P97334 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nkx2-3P97334 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nkx2-3P97334 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nkx2-3P97334 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nkx2-3P97334 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nkx2-3P97334 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nkx2-3P97334 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nkx2-3P97334 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nkx2-3P97334 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nkx2-3P97334 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nkx2-3P97334 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nkx2-3P97334 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nkx2-3P97334 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nkx2-3P97334 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nkx2-3P97334 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms