Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sparcl1P70663 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sparcl1P70663 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sparcl1P70663 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sparcl1P70663 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sparcl1P70663 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sparcl1P70663 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sparcl1P70663 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sparcl1P70663 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sparcl1P70663 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms