Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkn1P70268 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pkn1P70268 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkn1P70268 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pkn1P70268 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkn1P70268 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pkn1P70268 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkn1P70268 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms