Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,81■■■■■ 6,05
Abcc9P70170 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC52,8■■■■■ 6,04
Abcc9P70170 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC52,78■■■■■ 6,04
Abcc9P70170 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC52,77■■■■■ 6,04
Abcc9P70170 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC52,77■■■■■ 6,04
Abcc9P70170 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC52,76■■■■■ 6,04
Abcc9P70170 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,76■■■■■ 6,04
Abcc9P70170 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,75■■■■■ 6,04
Abcc9P70170 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52,75■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC52,74■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52,73■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52,73■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC52,71■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC52,71■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC52,7■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,69■■■■■ 6,03
Abcc9P70170 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52,69■■■■■ 6,02
Abcc9P70170 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,68■■■■■ 6,02
Abcc9P70170 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,66■■■■■ 6,02
Abcc9P70170 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC52,65■■■■■ 6,02
Abcc9P70170 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52,65■■■■■ 6,02
Abcc9P70170 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52,65■■■■■ 6,02
Abcc9P70170 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC52,61■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC52,61■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,61■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,6■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC52,59■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52,59■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,58■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,57■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC52,57■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,57■■■■■ 6,01
Abcc9P70170 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,55■■■■■ 6
Abcc9P70170 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,53■■■■■ 6
Abcc9P70170 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC52,52■■■■■ 6
Abcc9P70170 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC52,51■■■■■ 6
Abcc9P70170 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC52,51■■■■■ 6
Abcc9P70170 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52,51■■■■■ 6
Abcc9P70170 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC52,49■■■■■ 5,99
Abcc9P70170 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,48■■■■■ 5,99
Abcc9P70170 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC52,44■■■■■ 5,98
Abcc9P70170 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC52,41■■■■■ 5,98
Abcc9P70170 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC52,4■■■■■ 5,98
Abcc9P70170 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,38■■■■■ 5,98
Abcc9P70170 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52,37■■■■■ 5,97
Abcc9P70170 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC52,37■■■■■ 5,97
Abcc9P70170 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC52,32■■■■■ 5,97
Abcc9P70170 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52,31■■■■■ 5,97
Abcc9P70170 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC52,3■■■■■ 5,96
Abcc9P70170 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC52,3■■■■■ 5,96
Abcc9P70170 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC52,28■■■■■ 5,96
Abcc9P70170 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC52,25■■■■■ 5,95
Abcc9P70170 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC52,25■■■■■ 5,95
Abcc9P70170 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC52,25■■■■■ 5,95
Abcc9P70170 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC52,2■■■■■ 5,95
Abcc9P70170 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC52,2■■■■■ 5,95
Abcc9P70170 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,19■■■■■ 5,95
Abcc9P70170 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,19■■■■■ 5,95
Abcc9P70170 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC52,18■■■■■ 5,94
Abcc9P70170 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC52,17■■■■■ 5,94
Abcc9P70170 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC52,16■■■■■ 5,94
Abcc9P70170 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC52,16■■■■■ 5,94
Abcc9P70170 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC52,14■■■■■ 5,94
Abcc9P70170 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52,14■■■■■ 5,94
Abcc9P70170 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC52,13■■■■■ 5,94
Abcc9P70170 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,12■■■■■ 5,93
Abcc9P70170 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,12■■■■■ 5,93
Abcc9P70170 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC52,1■■■■■ 5,93
Abcc9P70170 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,1■■■■■ 5,93
Abcc9P70170 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC52,1■■■■■ 5,93
Abcc9P70170 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,06■■■■■ 5,92
Abcc9P70170 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,03■■■■■ 5,92
Abcc9P70170 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,03■■■■■ 5,92
Abcc9P70170 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52,03■■■■■ 5,92
Abcc9P70170 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC52,01■■■■■ 5,92
Abcc9P70170 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5,92
Abcc9P70170 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC51,99■■■■■ 5,91
Abcc9P70170 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC51,99■■■■■ 5,91
Abcc9P70170 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC51,95■■■■■ 5,91
Abcc9P70170 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC51,95■■■■■ 5,91
Abcc9P70170 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC51,94■■■■■ 5,91
Abcc9P70170 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51,94■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC51,93■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51,93■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC51,93■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,92■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC51,92■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC51,92■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC51,91■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,89■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,89■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC51,89■■■■■ 5,9
Abcc9P70170 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC51,88■■■■■ 5,89
Abcc9P70170 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,86■■■■■ 5,89
Abcc9P70170 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC51,86■■■■■ 5,89
Abcc9P70170 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC51,86■■■■■ 5,89
Abcc9P70170 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC51,82■■■■■ 5,89
Abcc9P70170 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC51,81■■■■■ 5,88
Abcc9P70170 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC51,8■■■■■ 5,88
Abcc9P70170 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,8■■■■■ 5,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms