Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Rbx1P62878 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,89■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,86■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17,86■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17,85■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17,83■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Rbx1P62878 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17,83■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17,79■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Rbx1P62878 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,75■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Rbx1P62878 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17,7■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17,7■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17,7■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,69■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17,68■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17,66■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Rbx1P62878 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,64■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,64■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17,63■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Rbx1P62878 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms