Protein–RNA interactions for Protein: P56655

Cyp2c38, Cytochrome P450 2C38, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c38P56655 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp2c38P56655 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp2c38P56655 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cyp2c38P56655 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cyp2c38P56655 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cyp2c38P56655 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp2c38P56655 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp2c38P56655 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cyp2c38P56655 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp2c38P56655 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp2c38P56655 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp2c38P56655 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp2c38P56655 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cyp2c38P56655 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms