Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ephb4P54761 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ephb4P54761 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ephb4P54761 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ephb4P54761 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ephb4P54761 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ephb4P54761 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ephb4P54761 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ephb4P54761 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ephb4P54761 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ephb4P54761 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ephb4P54761 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ephb4P54761 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ephb4P54761 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ephb4P54761 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ephb4P54761 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms