Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 SDH5YOL071W 489 nt8.66□□□□□ -1.02
NIC96P34077 ALP1YNL270C 1722 nt8.65□□□□□ -1.03
NIC96P34077 ALD5YER073W 1563 nt8.65□□□□□ -1.03
NIC96P34077 MTG2YHR168W 1557 nt8.65□□□□□ -1.03
NIC96P34077 ARO8YGL202W 1503 nt8.64□□□□□ -1.03
NIC96P34077 TSC10YBR265W 963 nt8.64□□□□□ -1.03
NIC96P34077 OPI10YOL032W 741 nt8.63□□□□□ -1.03
NIC96P34077 YPL041CYPL041C 624 nt8.63□□□□□ -1.03
NIC96P34077 DMA2YNL116W 1569 nt8.62□□□□□ -1.03
NIC96P34077 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
NIC96P34077 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
NIC96P34077 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
NIC96P34077 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
NIC96P34077 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
NIC96P34077 KES1YPL145C 1305 nt8.61□□□□□ -1.03
NIC96P34077 ZTA1YBR046C 1005 nt8.61□□□□□ -1.03
NIC96P34077 SGA1YIL099W 1650 nt8.61□□□□□ -1.03
NIC96P34077 SAM1YLR180W 1149 nt8.59□□□□□ -1.03
NIC96P34077 YBL086CYBL086C 1401 nt8.59□□□□□ -1.03
NIC96P34077 GLR1YPL091W 1452 nt8.58□□□□□ -1.04
NIC96P34077 SHY1YGR112W 1170 nt8.58□□□□□ -1.04
NIC96P34077 RSC8YFR037C 1674 nt8.58□□□□□ -1.04
NIC96P34077 YGR012WYGR012W 1182 nt8.57□□□□□ -1.04
NIC96P34077 YMR244WYMR244W 1068 nt8.57□□□□□ -1.04
NIC96P34077 BET2YPR176C 978 nt8.56□□□□□ -1.04
NIC96P34077 TOA2YKL058W 369 nt8.55□□□□□ -1.04
NIC96P34077 YLR279WYLR279W 390 nt8.55□□□□□ -1.04
NIC96P34077 CCT2YIL142W 1584 nt8.55□□□□□ -1.04
NIC96P34077 YLR111WYLR111W 333 nt8.54□□□□□ -1.04
NIC96P34077 BRR1YPR057W 1026 nt8.54□□□□□ -1.04
NIC96P34077 THI72YOR192C 1800 nt8.53□□□□□ -1.04
NIC96P34077 YPL251WYPL251W 303 nt8.52□□□□□ -1.05
NIC96P34077 CBK1YNL161W 2271 nt8.52□□□□□ -1.05
NIC96P34077 LEU9YOR108W 1815 nt8.52□□□□□ -1.05
NIC96P34077 MLS1YNL117W 1665 nt8.51□□□□□ -1.05
NIC96P34077 RAD23YEL037C 1197 nt8.51□□□□□ -1.05
NIC96P34077 SBA1YKL117W 651 nt8.51□□□□□ -1.05
NIC96P34077 AAC3YBR085W 924 nt8.51□□□□□ -1.05
NIC96P34077 YHR218WYHR218W 1812 nt8.51□□□□□ -1.05
NIC96P34077 MSB4YOL112W 1479 nt8.51□□□□□ -1.05
NIC96P34077 URA6YKL024C 615 nt8.5□□□□□ -1.05
NIC96P34077 CWC15YDR163W 528 nt8.49□□□□□ -1.05
NIC96P34077 YOR072WYOR072W 315 nt8.49□□□□□ -1.05
NIC96P34077 MEP3YPR138C 1470 nt8.49□□□□□ -1.05
NIC96P34077 ZAP1YJL056C 2643 nt8.49□□□□□ -1.05
NIC96P34077 LSB6YJL100W 1824 nt8.47□□□□□ -1.05
NIC96P34077 GND2YGR256W 1479 nt8.47□□□□□ -1.05
NIC96P34077 PCP1YGR101W 1041 nt8.47□□□□□ -1.05
NIC96P34077 SAM2YDR502C 1155 nt8.46□□□□□ -1.06
NIC96P34077 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.46□□□□□ -1.06
NIC96P34077 YMR103CYMR103C 363 nt8.46□□□□□ -1.06
NIC96P34077 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.46□□□□□ -1.06
NIC96P34077 UFO1YML088W 2007 nt8.46□□□□□ -1.06
NIC96P34077 YMR226CYMR226C 804 nt8.45□□□□□ -1.06
NIC96P34077 ODC1YPL134C 933 nt8.45□□□□□ -1.06
NIC96P34077 OYE3YPL171C 1203 nt8.45□□□□□ -1.06
NIC96P34077 GTB1YDR221W 2109 nt8.44□□□□□ -1.06
NIC96P34077 PET8YNL003C 855 nt8.44□□□□□ -1.06
NIC96P34077 GAL2YLR081W 1725 nt8.43□□□□□ -1.06
NIC96P34077 APT2YDR441C 546 nt8.41□□□□□ -1.06
NIC96P34077 RIB3YDR487C 627 nt8.41□□□□□ -1.06
NIC96P34077 MGM101YJR144W 810 nt8.4□□□□□ -1.06
NIC96P34077 FCY21YER060W 1587 nt8.39□□□□□ -1.07
NIC96P34077 GND1YHR183W 1470 nt8.38□□□□□ -1.07
NIC96P34077 COG1YGL223C 1254 nt8.38□□□□□ -1.07
NIC96P34077 HXT10YFL011W 1641 nt8.37□□□□□ -1.07
NIC96P34077 SEC61YLR378C 1443 nt8.36□□□□□ -1.07
NIC96P34077 QDR2YIL121W 1629 nt8.36□□□□□ -1.07
NIC96P34077 MEX67YPL169C 1800 nt8.36□□□□□ -1.07
NIC96P34077 RBG2YGR173W 1107 nt8.34□□□□□ -1.07
NIC96P34077 MTO1YGL236C 2010 nt8.34□□□□□ -1.07
NIC96P34077 SSL2YIL143C 2532 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 CAB5YDR196C 726 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 PRY1YJL079C 900 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 LOT5YKL183W 921 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 SMM1YNR015W 1155 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 SPP2YOR148C 558 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 TOK1YJL093C 2076 nt8.33□□□□□ -1.08
NIC96P34077 MDL2YPL270W 2322 nt8.32□□□□□ -1.08
NIC96P34077 YHR131CYHR131C 2553 nt8.32□□□□□ -1.08
NIC96P34077 GID8YMR135C 1368 nt8.32□□□□□ -1.08
NIC96P34077 OXA1YER154W 1209 nt8.31□□□□□ -1.08
NIC96P34077 FAF1YIL019W 1041 nt8.31□□□□□ -1.08
NIC96P34077 MDM35YKL053C-A 261 nt8.31□□□□□ -1.08
NIC96P34077 BNI5YNL166C 1347 nt8.3□□□□□ -1.08
NIC96P34077 NUC1YJL208C 990 nt8.3□□□□□ -1.08
NIC96P34077 FRA1YLL029W 2250 nt8.29□□□□□ -1.08
NIC96P34077 PHO23YNL097C 993 nt8.29□□□□□ -1.08
NIC96P34077 FMS1YMR020W 1527 nt8.29□□□□□ -1.08
NIC96P34077 VPS62YGR141W 1404 nt8.29□□□□□ -1.08
NIC96P34077 DLD2YDL178W 1593 nt8.28□□□□□ -1.08
NIC96P34077 YER188WYER188W 720 nt8.28□□□□□ -1.08
NIC96P34077 FLR1YBR008C 1647 nt8.28□□□□□ -1.08
NIC96P34077 MRS6YOR370C 1812 nt8.27□□□□□ -1.09
NIC96P34077 DIG1YPL049C 1359 nt8.27□□□□□ -1.09
NIC96P34077 LSB5YCL034W 1065 nt8.27□□□□□ -1.09
NIC96P34077 YPS3YLR121C 1527 nt8.27□□□□□ -1.09
NIC96P34077 MSC1YML128C 1542 nt8.27□□□□□ -1.09
NIC96P34077 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.26□□□□□ -1.09
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