Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Casp1P29452 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Casp1P29452 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Casp1P29452 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Casp1P29452 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Casp1P29452 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Casp1P29452 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Casp1P29452 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Casp1P29452 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Casp1P29452 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Casp1P29452 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Casp1P29452 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Casp1P29452 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casp1P29452 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Casp1P29452 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Casp1P29452 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Casp1P29452 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Casp1P29452 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Casp1P29452 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Casp1P29452 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Casp1P29452 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Casp1P29452 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Casp1P29452 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Casp1P29452 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Casp1P29452 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casp1P29452 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Casp1P29452 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Casp1P29452 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Casp1P29452 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casp1P29452 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casp1P29452 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casp1P29452 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casp1P29452 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casp1P29452 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Casp1P29452 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Casp1P29452 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Casp1P29452 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Casp1P29452 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Casp1P29452 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Casp1P29452 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Casp1P29452 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casp1P29452 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms