Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpbP28033 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpbP28033 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpbP28033 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpbP28033 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpbP28033 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpbP28033 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpbP28033 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CebpbP28033 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpbP28033 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpbP28033 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpbP28033 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpbP28033 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpbP28033 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CebpbP28033 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CebpbP28033 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpbP28033 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpbP28033 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpbP28033 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpbP28033 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CebpbP28033 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms