Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 snR78snR78 87 nt10.35□□□□□ -0.75
SPT5P27692 SWP1YMR149W 861 nt10.35□□□□□ -0.75
SPT5P27692 INA1YLR413W 2028 nt10.34□□□□□ -0.75
SPT5P27692 RPS14BYJL191W 417 nt10.34□□□□□ -0.75
SPT5P27692 YJL107CYJL107C 1164 nt10.33□□□□□ -0.76
SPT5P27692 TSC10YBR265W 963 nt10.33□□□□□ -0.76
SPT5P27692 AST1YBL069W 1290 nt10.32□□□□□ -0.76
SPT5P27692 TIF6YPR016C 738 nt10.32□□□□□ -0.76
SPT5P27692 HMG2YLR450W 3138 nt10.31□□□□□ -0.76
SPT5P27692 YMR244WYMR244W 1068 nt10.3□□□□□ -0.76
SPT5P27692 ACO2YJL200C 2370 nt10.29□□□□□ -0.76
SPT5P27692 TPO4YOR273C 1980 nt10.28□□□□□ -0.76
SPT5P27692 THP3YPR045C 1413 nt10.28□□□□□ -0.76
SPT5P27692 YNL165WYNL165W 1221 nt10.28□□□□□ -0.76
SPT5P27692 YNR068CYNR068C 819 nt10.27□□□□□ -0.77
SPT5P27692 HOS2YGL194C 1359 nt10.26□□□□□ -0.77
SPT5P27692 RAD23YEL037C 1197 nt10.26□□□□□ -0.77
SPT5P27692 YAR028WYAR028W 705 nt10.25□□□□□ -0.77
SPT5P27692 UTR1YJR049C 1593 nt10.24□□□□□ -0.77
SPT5P27692 SSN3YPL042C 1668 nt10.23□□□□□ -0.77
SPT5P27692 UGA4YDL210W 1716 nt10.23□□□□□ -0.77
SPT5P27692 RSM23YGL129C 1353 nt10.23□□□□□ -0.77
SPT5P27692 DIF1YLR437C 402 nt10.22□□□□□ -0.77
SPT5P27692 GID7YCL039W 2238 nt10.21□□□□□ -0.77
SPT5P27692 ALP1YNL270C 1722 nt10.21□□□□□ -0.78
SPT5P27692 RBG2YGR173W 1107 nt10.2□□□□□ -0.78
SPT5P27692 MAS1YLR163C 1389 nt10.2□□□□□ -0.78
SPT5P27692 URE2YNL229C 1065 nt10.2□□□□□ -0.78
SPT5P27692 HOL1YNR055C 1761 nt10.2□□□□□ -0.78
SPT5P27692 ALD4YOR374W 1560 nt10.19□□□□□ -0.78
SPT5P27692 YGR012WYGR012W 1182 nt10.19□□□□□ -0.78
SPT5P27692 EEB1YPL095C 1371 nt10.16□□□□□ -0.78
SPT5P27692 APM1YPL259C 1428 nt10.16□□□□□ -0.78
SPT5P27692 PIC2YER053C 903 nt10.15□□□□□ -0.78
SPT5P27692 PRM5YIL117C 957 nt10.15□□□□□ -0.78
SPT5P27692 YCR099CYCR099C 468 nt10.14□□□□□ -0.79
SPT5P27692 YJL211CYJL211C 444 nt10.14□□□□□ -0.79
SPT5P27692 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.14□□□□□ -0.79
SPT5P27692 YMR147WYMR147W 672 nt10.13□□□□□ -0.79
SPT5P27692 SCO2YBR024W 906 nt10.13□□□□□ -0.79
SPT5P27692 AKR2YOR034C 2250 nt10.12□□□□□ -0.79
SPT5P27692 SED1YDR077W 1017 nt10.12□□□□□ -0.79
SPT5P27692 YGL118CYGL118C 438 nt10.12□□□□□ -0.79
SPT5P27692 COX16YJL003W 357 nt10.12□□□□□ -0.79
SPT5P27692 RMA1YKL132C 1293 nt10.11□□□□□ -0.79
SPT5P27692 RIB3YDR487C 627 nt10.09□□□□□ -0.79
SPT5P27692 YEL074WYEL074W 339 nt10.09□□□□□ -0.79
SPT5P27692 YLR279WYLR279W 390 nt10.09□□□□□ -0.79
SPT5P27692 NAT5YOR253W 531 nt10.09□□□□□ -0.79
SPT5P27692 MOD5YOR274W 1287 nt10.09□□□□□ -0.79
SPT5P27692 LIP1YMR298W 453 nt10.08□□□□□ -0.8
SPT5P27692 YBL081WYBL081W 1107 nt10.08□□□□□ -0.8
SPT5P27692 URA8YJR103W 1737 nt10.07□□□□□ -0.8
SPT5P27692 MTG2YHR168W 1557 nt10.06□□□□□ -0.8
SPT5P27692 HXT1YHR094C 1713 nt10.06□□□□□ -0.8
SPT5P27692 ICE2YIL090W 1476 nt10.05□□□□□ -0.8
SPT5P27692 YMR209CYMR209C 1374 nt10.05□□□□□ -0.8
SPT5P27692 HIF1YLL022C 1158 nt10.05□□□□□ -0.8
SPT5P27692 YHP1YDR451C 1062 nt10.04□□□□□ -0.8
SPT5P27692 BSP1YPR171W 1731 nt10.03□□□□□ -0.8
SPT5P27692 APT2YDR441C 546 nt10.02□□□□□ -0.81
SPT5P27692 LSM12YHR121W 564 nt10.02□□□□□ -0.81
SPT5P27692 AIM41YOR215C 558 nt10.02□□□□□ -0.81
SPT5P27692 GND1YHR183W 1470 nt10.02□□□□□ -0.81
SPT5P27692 SAM1YLR180W 1149 nt10.01□□□□□ -0.81
SPT5P27692 IDP3YNL009W 1263 nt10□□□□□ -0.81
SPT5P27692 MSB4YOL112W 1479 nt9.99□□□□□ -0.81
SPT5P27692 ZRT3YKL175W 1512 nt9.99□□□□□ -0.81
SPT5P27692 PZF1YPR186C 1290 nt9.99□□□□□ -0.81
SPT5P27692 YDR306CYDR306C 1437 nt9.99□□□□□ -0.81
SPT5P27692 YHL008CYHL008C 1884 nt9.98□□□□□ -0.81
SPT5P27692 ATG22YCL038C 1587 nt9.97□□□□□ -0.81
SPT5P27692 DBP1YPL119C 1854 nt9.97□□□□□ -0.81
SPT5P27692 GET2YER083C 858 nt9.96□□□□□ -0.82
SPT5P27692 ZTA1YBR046C 1005 nt9.96□□□□□ -0.82
SPT5P27692 BNA3YJL060W 1335 nt9.96□□□□□ -0.82
SPT5P27692 ESBP6YNL125C 2022 nt9.95□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.95□□□□□ -0.82
SPT5P27692 PUS7YOR243C 2031 nt9.94□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YPI1YFR003C 468 nt9.93□□□□□ -0.82
SPT5P27692 RFC1YOR217W 2586 nt9.92□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
SPT5P27692 TOA2YKL058W 369 nt9.92□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.92□□□□□ -0.82
SPT5P27692 SIR2YDL042C 1689 nt9.91□□□□□ -0.82
SPT5P27692 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt9.91□□□□□ -0.82
SPT5P27692 PCL10YGL134W 1302 nt9.9□□□□□ -0.82
SPT5P27692 MRS3YJL133W 945 nt9.9□□□□□ -0.82
SPT5P27692 LOT5YKL183W 921 nt9.9□□□□□ -0.82
SPT5P27692 BRR1YPR057W 1026 nt9.9□□□□□ -0.82
SPT5P27692 OCA1YNL099C 717 nt9.89□□□□□ -0.83
SPT5P27692 FCY21YER060W 1587 nt9.88□□□□□ -0.83
SPT5P27692 SAM2YDR502C 1155 nt9.88□□□□□ -0.83
SPT5P27692 MRPL36YBR122C 534 nt9.88□□□□□ -0.83
SPT5P27692 LEU9YOR108W 1815 nt9.88□□□□□ -0.83
SPT5P27692 YBL086CYBL086C 1401 nt9.88□□□□□ -0.83
SPT5P27692 MEP3YPR138C 1470 nt9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms