Protein–RNA interactions for Protein: P01863

Ighg, Ig gamma-2A chain C region, A allele, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IghgP01863 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IghgP01863 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IghgP01863 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IghgP01863 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IghgP01863 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IghgP01863 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IghgP01863 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IghgP01863 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IghgP01863 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IghgP01863 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IghgP01863 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IghgP01863 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IghgP01863 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IghgP01863 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IghgP01863 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IghgP01863 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IghgP01863 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IghgP01863 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IghgP01863 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IghgP01863 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IghgP01863 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IghgP01863 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IghgP01863 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IghgP01863 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IghgP01863 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IghgP01863 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IghgP01863 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IghgP01863 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IghgP01863 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IghgP01863 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IghgP01863 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IghgP01863 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IghgP01863 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IghgP01863 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IghgP01863 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IghgP01863 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IghgP01863 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IghgP01863 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IghgP01863 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IghgP01863 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IghgP01863 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IghgP01863 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IghgP01863 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IghgP01863 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IghgP01863 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IghgP01863 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IghgP01863 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IghgP01863 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IghgP01863 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IghgP01863 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IghgP01863 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IghgP01863 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IghgP01863 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IghgP01863 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IghgP01863 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IghgP01863 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IghgP01863 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IghgP01863 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IghgP01863 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IghgP01863 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IghgP01863 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IghgP01863 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IghgP01863 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IghgP01863 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IghgP01863 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IghgP01863 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IghgP01863 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IghgP01863 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IghgP01863 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IghgP01863 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IghgP01863 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IghgP01863 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IghgP01863 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IghgP01863 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IghgP01863 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IghgP01863 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IghgP01863 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IghgP01863 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IghgP01863 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IghgP01863 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IghgP01863 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IghgP01863 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IghgP01863 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IghgP01863 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IghgP01863 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IghgP01863 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IghgP01863 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IghgP01863 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IghgP01863 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IghgP01863 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IghgP01863 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IghgP01863 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IghgP01863 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IghgP01863 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IghgP01863 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IghgP01863 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IghgP01863 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IghgP01863 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IghgP01863 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IghgP01863 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.6 ms