Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ComtO88587 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ComtO88587 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ComtO88587 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ComtO88587 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ComtO88587 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ComtO88587 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ComtO88587 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ComtO88587 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ComtO88587 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ComtO88587 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ComtO88587 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ComtO88587 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ComtO88587 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ComtO88587 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ComtO88587 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ComtO88587 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ComtO88587 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ComtO88587 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ComtO88587 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ComtO88587 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ComtO88587 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ComtO88587 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ComtO88587 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ComtO88587 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ComtO88587 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ComtO88587 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ComtO88587 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ComtO88587 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ComtO88587 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ComtO88587 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ComtO88587 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ComtO88587 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ComtO88587 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ComtO88587 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ComtO88587 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ComtO88587 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ComtO88587 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ComtO88587 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ComtO88587 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ComtO88587 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ComtO88587 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ComtO88587 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ComtO88587 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ComtO88587 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ComtO88587 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ComtO88587 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ComtO88587 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ComtO88587 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ComtO88587 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ComtO88587 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ComtO88587 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ComtO88587 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ComtO88587 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ComtO88587 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ComtO88587 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ComtO88587 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ComtO88587 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ComtO88587 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ComtO88587 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ComtO88587 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ComtO88587 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ComtO88587 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ComtO88587 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ComtO88587 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ComtO88587 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ComtO88587 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ComtO88587 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ComtO88587 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ComtO88587 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ComtO88587 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ComtO88587 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ComtO88587 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ComtO88587 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ComtO88587 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ComtO88587 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ComtO88587 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ComtO88587 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ComtO88587 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ComtO88587 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ComtO88587 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ComtO88587 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ComtO88587 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ComtO88587 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ComtO88587 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ComtO88587 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ComtO88587 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ComtO88587 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ComtO88587 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ComtO88587 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ComtO88587 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ComtO88587 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ComtO88587 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ComtO88587 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ComtO88587 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ComtO88587 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ComtO88587 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ComtO88587 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ComtO88587 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ComtO88587 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms