Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn2O88552 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn2O88552 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn2O88552 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn2O88552 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cldn2O88552 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn2O88552 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cldn2O88552 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cldn2O88552 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms