Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd46O88174 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd46O88174 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd46O88174 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd46O88174 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd46O88174 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd46O88174 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd46O88174 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd46O88174 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd46O88174 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd46O88174 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd46O88174 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd46O88174 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd46O88174 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd46O88174 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd46O88174 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd46O88174 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd46O88174 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd46O88174 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd46O88174 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd46O88174 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd46O88174 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd46O88174 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd46O88174 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd46O88174 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd46O88174 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd46O88174 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd46O88174 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd46O88174 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd46O88174 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd46O88174 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd46O88174 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd46O88174 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd46O88174 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd46O88174 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms