Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d1bO35324 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d1bO35324 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d1bO35324 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2d1bO35324 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2d1bO35324 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2d1bO35324 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d1bO35324 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2d1bO35324 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d1bO35324 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d1bO35324 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d1bO35324 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d1bO35324 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 978.6 ms